Ο Gianni De Magistris γεννήθηκε στις 3 Δεκεμβρίου 1950 στη Φλωρεντία. Ξεκίνησε ως αθλητής στην κολύμβηση (μεταξύ άλλων κατέκτησε το ιταλικό πρωτάθλημα στα 1.500 μέτρα ελεύθερου το 1967) και στη συνέχεια πέρασε στο πόλο. Ως παίκτης πόλο, αγωνίστηκε σχεδόν όλη του την καριέρα στην ομάδα Rari Nantes Florentia — με την οποία κατέκτησε δύο πρωταθλήματα Ιταλίας (1976 και 1980) και Κύπελλο Ιταλίας το 1976.

Σε εθνικό επίπεδο, αποτέλεσε βασικό στέλεχος της εθνικής ομάδας της Ιταλίας: συμμετείχε σε πέντε διαδοχικές Ολυμπιάδες (1968, 1972, 1976, 1980, 1984) — μία από τις πολύ σπάνιες περιπτώσεις στην ιστορία του αθλήματος. Με την εθνική Ιταλίας κατέκτησε: χρυσό μετάλλιο στο Παγκόσμιο Πρωτάθλημα του 1978, χάλκινο στο Παγκόσμιο του 1975, και χάλκινο στο Ευρωπαϊκό του 1977. Επίσης, στην Ολυμπιάδα του 1976 στο Μόντρεαλ κέρδισε το ασημένιο μετάλλιο.

Μετά το τέλος της αθλητικής του καριέρας έγινε προπονητής: πέρασε από την ανδρική ομάδα της Rari Nantes Florentia και αργότερα προπονούσε την ομάδα γυναικείου πόλο της Fiorentina Waterpolo  με την οποία κατέκτησε το 2006-07 πρωτάθλημα Ιταλίας,  Ευρωπαϊκό Κύπελλο και το Ευρωπαϊκό Super cup.

Τιμητικές διακρίσεις: από το 1995 είναι μέλος της International Swimming Hall of Fame.